MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4

Total Repeats: 700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008506	TTA	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
2	NC_008506	TGT	2	6	115	120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326610
3	NC_008506	AT	3	6	163	168	50 %	50 %	0 %	0 %	116326610
4	NC_008506	ATC	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326610
5	NC_008506	ACC	2	6	303	308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326610
6	NC_008506	GCC	2	6	313	318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326610
7	NC_008506	CTG	3	9	338	346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326610
8	NC_008506	GCAA	2	8	364	371	50 %	0 %	25 %	25 %	116326610
9	NC_008506	ATT	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
10	NC_008506	TGC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326610
11	NC_008506	TCT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326610
12	NC_008506	GTTT	2	8	531	538	0 %	75 %	25 %	0 %	116326610
13	NC_008506	TTC	3	9	549	557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326610
14	NC_008506	TAA	2	6	592	597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326610
15	NC_008506	CAA	2	6	608	613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
16	NC_008506	CAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
17	NC_008506	AAC	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
18	NC_008506	CAAT	2	8	926	933	50 %	25 %	0 %	25 %	116326610
19	NC_008506	TGT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326610
20	NC_008506	AGC	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326610
21	NC_008506	CAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
22	NC_008506	AGA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
23	NC_008506	GATT	2	8	1185	1192	25 %	50 %	25 %	0 %	116326610
24	NC_008506	AAC	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
25	NC_008506	GA	3	6	1289	1294	50 %	0 %	50 %	0 %	116326610
26	NC_008506	TGG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326610
27	NC_008506	ATT	2	6	1332	1337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
28	NC_008506	CA	3	6	1341	1346	50 %	0 %	0 %	50 %	116326610
29	NC_008506	AAG	2	6	1423	1428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
30	NC_008506	CCT	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326610
31	NC_008506	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
32	NC_008506	AGGT	2	8	1518	1525	25 %	25 %	50 %	0 %	116326610
33	NC_008506	GTA	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326610
34	NC_008506	CCA	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326610
35	NC_008506	TCA	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326610
36	NC_008506	AGAT	2	8	1682	1689	50 %	25 %	25 %	0 %	116326610
37	NC_008506	AGAT	2	8	1741	1748	50 %	25 %	25 %	0 %	116326610
38	NC_008506	GA	3	6	1754	1759	50 %	0 %	50 %	0 %	116326610
39	NC_008506	ATTA	2	8	1810	1817	50 %	50 %	0 %	0 %	116326610
40	NC_008506	CTC	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326611
41	NC_008506	TGA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326611
42	NC_008506	TAA	2	6	1866	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326611
43	NC_008506	TCA	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
44	NC_008506	CAT	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
45	NC_008506	TCC	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326611
46	NC_008506	TGCAA	2	10	1980	1989	40 %	20 %	20 %	20 %	116326611
47	NC_008506	CTA	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
48	NC_008506	GAGC	2	8	2068	2075	25 %	0 %	50 %	25 %	116326611
49	NC_008506	CAA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326611
50	NC_008506	AG	3	6	2108	2113	50 %	0 %	50 %	0 %	116326611
51	NC_008506	TCTCT	2	10	2117	2126	0 %	60 %	0 %	40 %	116326611
52	NC_008506	CAA	2	6	2132	2137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326611
53	NC_008506	TCA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
54	NC_008506	AGT	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326612
55	NC_008506	TGC	2	6	2253	2258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326612
56	NC_008506	CTT	2	6	2267	2272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
57	NC_008506	CTT	3	9	2423	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
58	NC_008506	CAG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326612
59	NC_008506	TCA	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
60	NC_008506	AAG	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
61	NC_008506	TTG	2	6	2718	2723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326612
62	NC_008506	CAT	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
63	NC_008506	T	6	6	2861	2866	0 %	100 %	0 %	0 %	116326612
64	NC_008506	AAG	3	9	2874	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
65	NC_008506	CTT	2	6	2888	2893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
66	NC_008506	TTG	2	6	2906	2911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326612
67	NC_008506	GAA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
68	NC_008506	TCA	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
69	NC_008506	TTC	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
70	NC_008506	CAC	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326612
71	NC_008506	TCTGT	2	10	3122	3131	0 %	60 %	20 %	20 %	116326612
72	NC_008506	TAA	2	6	3254	3259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
73	NC_008506	T	7	7	3271	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	116326613
74	NC_008506	AAC	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326613
75	NC_008506	TTC	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
76	NC_008506	CTT	2	6	3487	3492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
77	NC_008506	ATT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326613
78	NC_008506	CGA	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326613
79	NC_008506	GTG	2	6	3571	3576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326613
80	NC_008506	ATA	2	6	3638	3643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
81	NC_008506	TAA	2	6	3700	3705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
82	NC_008506	CTT	2	6	3736	3741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
83	NC_008506	TTG	2	6	3751	3756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326613
84	NC_008506	ACC	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326613
85	NC_008506	CCA	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326613
86	NC_008506	CAC	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
87	NC_008506	CAAT	2	8	4187	4194	50 %	25 %	0 %	25 %	116326614
88	NC_008506	T	6	6	4194	4199	0 %	100 %	0 %	0 %	116326614
89	NC_008506	TCT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326614
90	NC_008506	ATG	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326614
91	NC_008506	TCAT	2	8	4249	4256	25 %	50 %	0 %	25 %	116326614
92	NC_008506	AAG	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326614
93	NC_008506	ACC	2	6	4263	4268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
94	NC_008506	CCA	2	6	4279	4284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
95	NC_008506	TTC	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326614
96	NC_008506	TTTA	2	8	4371	4378	25 %	75 %	0 %	0 %	116326614
97	NC_008506	ATAC	2	8	4411	4418	50 %	25 %	0 %	25 %	116326614
98	NC_008506	TAC	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326614
99	NC_008506	T	6	6	4458	4463	0 %	100 %	0 %	0 %	116326614
100	NC_008506	ATAG	2	8	4467	4474	50 %	25 %	25 %	0 %	116326614
101	NC_008506	GTAC	2	8	4483	4490	25 %	25 %	25 %	25 %	116326614
102	NC_008506	T	6	6	4601	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	116326614
103	NC_008506	TGA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326615
104	NC_008506	CAT	2	6	4665	4670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326615
105	NC_008506	TCA	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326615
106	NC_008506	CGA	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326615
107	NC_008506	CTG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326615
108	NC_008506	TTTA	2	8	4888	4895	25 %	75 %	0 %	0 %	116326615
109	NC_008506	CAA	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326615
110	NC_008506	GTCC	2	8	4935	4942	0 %	25 %	25 %	50 %	116326615
111	NC_008506	CTT	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326615
112	NC_008506	A	6	6	5538	5543	100 %	0 %	0 %	0 %	116326616
113	NC_008506	CGA	2	6	5544	5549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326616
114	NC_008506	A	6	6	5554	5559	100 %	0 %	0 %	0 %	116326616
115	NC_008506	ACCATA	2	12	5586	5597	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116326616
116	NC_008506	ATA	2	6	5604	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326616
117	NC_008506	TGG	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326616
118	NC_008506	GAA	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326616
119	NC_008506	A	6	6	5767	5772	100 %	0 %	0 %	0 %	116326616
120	NC_008506	A	6	6	5784	5789	100 %	0 %	0 %	0 %	116326616
121	NC_008506	CTT	2	6	5958	5963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326616
122	NC_008506	AAGG	2	8	6099	6106	50 %	0 %	50 %	0 %	116326616
123	NC_008506	CAA	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326616
124	NC_008506	TTA	2	6	6150	6155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326616
125	NC_008506	TCGA	2	8	6172	6179	25 %	25 %	25 %	25 %	116326616
126	NC_008506	CAT	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326616
127	NC_008506	ACT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326616
128	NC_008506	T	6	6	6823	6828	0 %	100 %	0 %	0 %	116326617
129	NC_008506	ATC	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326617
130	NC_008506	TTC	2	6	6936	6941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326617
131	NC_008506	T	6	6	6997	7002	0 %	100 %	0 %	0 %	116326617
132	NC_008506	TAT	2	6	7088	7093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326617
133	NC_008506	AT	3	6	7112	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	116326617
134	NC_008506	CTT	2	6	7292	7297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326617
135	NC_008506	CTT	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326617
136	NC_008506	ACG	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326618
137	NC_008506	CAA	2	6	7575	7580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326618
138	NC_008506	CTCTA	2	10	7598	7607	20 %	40 %	0 %	40 %	116326618
139	NC_008506	GAA	2	6	7676	7681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326618
140	NC_008506	A	7	7	7693	7699	100 %	0 %	0 %	0 %	116326618
141	NC_008506	AGTG	2	8	7728	7735	25 %	25 %	50 %	0 %	116326618
142	NC_008506	GCA	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326619
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149	NC_008506	GCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326619
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153	NC_008506	TGGT	2	8	8710	8717	0 %	50 %	50 %	0 %	116326619
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157	NC_008506	CTT	2	6	8943	8948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326619
158	NC_008506	T	6	6	8953	8958	0 %	100 %	0 %	0 %	116326619
159	NC_008506	TGA	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326619
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167	NC_008506	CTT	2	6	9558	9563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326619
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174	NC_008506	TTG	2	6	9864	9869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326619
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259	NC_008506	TAA	2	6	15098	15103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326622
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261	NC_008506	GGA	2	6	16350	16355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326623
262	NC_008506	TTG	2	6	16406	16411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326623
263	NC_008506	AAAG	2	8	16457	16464	75 %	0 %	25 %	0 %	116326623
264	NC_008506	GCT	2	6	16494	16499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326623
265	NC_008506	TCC	2	6	16517	16522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326623
266	NC_008506	TTC	2	6	16619	16624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326623
267	NC_008506	ACC	2	6	16648	16653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326623
268	NC_008506	CTT	2	6	16669	16674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326623
269	NC_008506	GTT	2	6	16691	16696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326623
270	NC_008506	TGA	2	6	16754	16759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326623
271	NC_008506	AG	3	6	16770	16775	50 %	0 %	50 %	0 %	116326623
272	NC_008506	TGC	2	6	16796	16801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326623
273	NC_008506	TAA	2	6	16833	16838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326623
274	NC_008506	TCT	2	6	16884	16889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326623
275	NC_008506	AG	4	8	16948	16955	50 %	0 %	50 %	0 %	116326623
276	NC_008506	GTT	2	6	16962	16967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326623
277	NC_008506	T	6	6	17159	17164	0 %	100 %	0 %	0 %	116326623
278	NC_008506	CTT	2	6	17232	17237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326623
279	NC_008506	CTT	2	6	17239	17244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326623
280	NC_008506	CCA	2	6	17274	17279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326623
281	NC_008506	GAA	2	6	17300	17305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326623
282	NC_008506	TTC	2	6	17363	17368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326623
283	NC_008506	TTAA	2	8	17448	17455	50 %	50 %	0 %	0 %	116326623
284	NC_008506	GAT	2	6	17509	17514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326623
285	NC_008506	TCT	2	6	17601	17606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326623
286	NC_008506	T	7	7	17672	17678	0 %	100 %	0 %	0 %	116326623
287	NC_008506	TCA	2	6	17688	17693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326623
288	NC_008506	TAA	2	6	17697	17702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326623
289	NC_008506	ATT	2	6	17831	17836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326623
290	NC_008506	T	6	6	17883	17888	0 %	100 %	0 %	0 %	116326623
291	NC_008506	CTTG	2	8	17913	17920	0 %	50 %	25 %	25 %	116326623
292	NC_008506	TAT	2	6	17935	17940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326623
293	NC_008506	GTAG	2	8	17976	17983	25 %	25 %	50 %	0 %	116326623
294	NC_008506	T	6	6	18027	18032	0 %	100 %	0 %	0 %	116326623
295	NC_008506	TCA	2	6	18042	18047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326623
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299	NC_008506	AGA	2	6	18288	18293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326624
300	NC_008506	AAC	2	6	18393	18398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326624
301	NC_008506	T	6	6	18405	18410	0 %	100 %	0 %	0 %	116326624
302	NC_008506	TCT	2	6	18418	18423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326624
303	NC_008506	GCT	2	6	18439	18444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326624
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305	NC_008506	TTG	2	6	18558	18563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326624
306	NC_008506	GGA	2	6	18622	18627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326624
307	NC_008506	GTC	2	6	18628	18633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326624
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321	NC_008506	CAA	2	6	19571	19576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326624
322	NC_008506	CTC	2	6	19748	19753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326624
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328	NC_008506	T	7	7	19965	19971	0 %	100 %	0 %	0 %	116326624
329	NC_008506	GTACTT	2	12	19972	19983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116326624
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331	NC_008506	ACTAC	2	10	20029	20038	40 %	20 %	0 %	40 %	116326624
332	NC_008506	ATA	2	6	20234	20239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326625
333	NC_008506	CAC	2	6	20245	20250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326625
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339	NC_008506	ATA	2	6	20822	20827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326625
340	NC_008506	CCA	2	6	20834	20839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326625
341	NC_008506	GTC	2	6	20864	20869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326625
342	NC_008506	TTG	2	6	20973	20978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326625
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345	NC_008506	TTC	2	6	21007	21012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326625
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348	NC_008506	ATA	2	6	21110	21115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326626
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352	NC_008506	TAA	2	6	21154	21159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326626
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362	NC_008506	TCA	2	6	21768	21773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326626
363	NC_008506	CCA	2	6	21847	21852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326626
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378	NC_008506	AAT	2	6	22560	22565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326627
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380	NC_008506	T	8	8	22725	22732	0 %	100 %	0 %	0 %	116326627
381	NC_008506	CAA	2	6	22786	22791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326627
382	NC_008506	ATA	2	6	22931	22936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326627
383	NC_008506	T	6	6	23011	23016	0 %	100 %	0 %	0 %	116326628
384	NC_008506	GAA	2	6	23045	23050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326628
385	NC_008506	T	6	6	23061	23066	0 %	100 %	0 %	0 %	116326628
386	NC_008506	CTT	3	9	23085	23093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326628
387	NC_008506	CGAG	2	8	23108	23115	25 %	0 %	50 %	25 %	116326628
388	NC_008506	AAAT	2	8	23116	23123	75 %	25 %	0 %	0 %	116326628
389	NC_008506	ATC	2	6	23179	23184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326628
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